runjob 本地和集群任务使用示例

runjob 是 job 格式任务文件投递到 SGE 集群、Slurm 集群或本地运行的命令。

1. 使用示例

准备job任务文件，文件中的每个任务会根据依赖关系投递到计算资源中：

log_dir /path/to/logdir

job_begin
    name jobA
    sched_options -q all.q -l vf=1g,p=1
    cmd_begin
        echo hello from job jobA
    cmd_end
job_end

job_begin
    name jobB
    sched_options -q all.q -l vf=1g,p=1
    cmd_begin
        echo hello from job jobB
    cmd_end
job_end

job_begin
    name jobC
    host localhost
    cmd_begin
        echo hello from job jobC
    cmd_end
job_end

order jobC after jobA jobB

使用命令投递任务：

runjob -j test.job -M sge -l test.log

2. 使用说明

• 上述示例中 jobA 和 jobB 并发投递到集群运行，jobC 等待前两个完成后在本地运行。

• 运行过程中可以通过 qs test.log 查看任务状态。

• runjob 命令可以后台 nohup 挂起。

• 终止 runjob 进程会自动清理正在运行中的任务。

• 使用 runjob -M local 即可投递到本地服务器。

• 支持 --dag 和 --dag-extend 输出任务依赖图。