runjob本地和SGE任务使用示例

runjob是job格式的任务文件投递到SGE或本地运行的命令

1. 使用示例

准备job任务文件，文件中的每个任务会根据依赖关系投递到计算资源中

log_dir /path/to/logdir

job_begin
    name jobA    
    sched_options -q all.q -l vf=1g,p=1
    cmd_begin
        echo hello from job jobA
    cmd_end
job_end

job_begin
    name jobB
    sched_options -q all.q -l vf=1g,p=1
    cmd_begin
        echo hello from job jobB
    cmd_end
job_end

job_begin
    name jobC
    host localhost
    sched_options -q all.q -l vf=1g,p=1
    cmd_begin
        echo hello from job jobC
    cmd_end
job_end


order jobC after jobA jobB

使用命令runjob -j test.job -m sge -l test.log 即可将任务投递到计算资源中。

2. 使用说明

• 上述示例中jobA和jobB两个任务并发到SGE集群运行，jobC任务会等待jobA和jobB运行完成之后进行投递，由于jobC指定了host localhost，所以jobC会在本地运行。

• 运行过程中可以通过查看test.log文件查看任务运行情况，或者通过qs test.log命令统计任务运行状态。

• runjob命令可以后台nohup挂起，避免意外中断。

• 终止runjob进程，会中断投递，同时清空正在运行中的任务。

• 使用runjob -m local命令即可将test.job文件中的任务投递到本地服务器运行。